科研服务

科研服务

CircRNA整体研究方案

相关知识:

环状RNA(circular RNA,circRNA)是最近发现的一类特殊的非编码RNA,它大量存在于真核细胞胞质内,主要由pre-mRNA通过可变剪切加工产生。近年研究发现,circRNA具有很多重要的调控功能,例如,circRNA可以作为竞争性内源RNA(competing endogenous RNA,ceRNA)结合胞内miRNA,阻断miRNA对其靶基因的抑制作用。除此以外,circRNA也具有调控其他类型RNA、调节蛋白质活性等功能。circRNA在不同物种中具有保守性,而且存在组织表达差异,且circRNA的环状结构对RNase不敏感,导致它比线性RNA更为稳定,这些特性使得circRNA具有开发疾病新型诊断与治疗方法的巨大潜力,研究意义重大。

服务内容:

服务内容:

1)环状RNA生物信息学预测

2) 环状RNA高通量测序

3)环状RNA表达丰度检测

4)FISH 检测环状RNA的亚细胞定位

5)NorthernBlot 检测环化RNA的存在

6)环状RNA的过表达实验(Gain of function)

7)环状RNA功能缺失实验(Loss of function )

8)环状RNA与miRNA互作结合生物预测及实验验证

9)环状RNA与miRNA相互作用预测研究 

10)环状RNA与蛋白相互作用研究

circRNA的形成(A)以及作用机制(B)

重要意义:

在对circRNA 结构和功能研究的基础上,有研究人员发现它们在动脉粥样硬化,神经系统紊乱,糖尿病和肿瘤等疾病发生过程中,发挥非常重要的作用。对环状RNA研究具有重要的意义:

1)circRNA独具的竞争性内源(ceRNA)特征可为药物开发提供新的思路;

2)circRNA的组织特异性和稳定性有可能使circRNA成为一种良好的生物标志物;

3)circRNA 的研究为生命的进化研究提供新的方向。

circRNA相关数据库:

circBase: http://www.circbase.org/
circNET: http://circnet.mbc.nctu.edu.tw/
StarBase V2: http://deepbase.sysu.edu.cn/
CircInteractome: http://circinteractome.nia.nih.gov/
Circ2Traits: http://gyanxet-beta.com/circdb/
CSCD: http://gb.whu.edu.cn/CSCD
exoRBase: http://www.exoRBase.org 

应用范畴:

circRNA技术及研究策略


  • 关注服务号

  • 关注订阅号

Copyright © 2016广州维伯鑫生物科技有限公司. All Rights Reserved Powered by Vancheer